水力部門は、東北・新潟地域の豊かな自然環境を活かし、CO2排出量が少なく、再生可能な純国産エネルギーの水力発電に取り組んでおり、全203箇所の水力発電所を管理しています。これは全国の発電事業者の中でも、最多の水力発電所保有数です。これらすべての水力発電所は無人であり、福島県会津若松市内にある水力運用センターで遠隔監視制御を行っています。各県には水力発電所の保守管理を担う発電技術センターがあり、有事の際は現地の水力発電所に赴き、故障復旧発生時の対応や機器の健全性の確認を行っています。